Top Promoters Bound by dicA

On this page you can access the list of promoter regions bound by dicA. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs) Scores Ranks
intK-ydfX-dicC 1.000 1
dicA 1.000 2
ydfA-ydfB-ydfC 0.945 3
fimA3p 0.626 4
fimB 0.626 5
yhiY 0.606 6
ydfJ 0.591 7
yhaJ 0.527 8
yahL 0.517 9
fhuA,fhuA-fhuC,fhuA-fhuC-fhuD,fhuA-fhuC-fhuD-fhuB 0.477 10
exuR 0.461 11
pncA 0.418 12
secM-secA-mutT,secM-secA,secM 0.410 13
ycgM,ycgM-ycgN 0.383 14
pliG 0.383 15
ycgL 0.383 15
cydA-cydB-ybgE-cydX,cydA-cydB,cydA-cydB-ybgE-ybgC-cydX,cydA,cydA-cydB-cydX 0.381 17
setC 0.369 18
gstB 0.336 19
dacC 0.336 19
yqfA 0.326 21
bglA 0.326 22
agp 0.319 23
ykfM 0.314 24
yafU 0.314 25
yafF 0.314 26
accB-accC,accB-accC-yhdT 0.307 27
yneO 0.306 28
rarD-yigI,yigF-yigG-rarD-yigI,yigI 0.303 29
pldA,pldA-recQ 0.303 30
ldtA 0.302 31
gpmA-galM 0.298 32
caiE-caiD-caiC-caiB-caiA-caiT 0.292 33
fixA-fixB-fixC,fixA-fixB-fixC-fixX 0.292 34
araG-araF-araH 0.289 35
ftnB 0.289 35
htrE-yadV 0.287 37
ychF-pth 0.286 38
ychH 0.286 38
micF 0.284 40
rcsD-rcsB 0.284 41
aroL-yaiA-aroM,aroL-yaiA 0.284 42
icdC 0.281 43
ybaB-recR 0.276 44
lacI-mhpR 0.274 45
mhpA-mhpB-mhpC-mhpD-mhpF-mhpE 0.274 46
csiD-lhgO-gabD-gabT-gabP 0.274 47
ysgA 0.273 48
udp-rmuC,udp,udp-rmuC-ubiE-ubiJ-esrE 0.273 48
adhE 0.272 51
ychT 0.272 51
ychE 0.272 51
oppA5p 0.272 53
yafC 0.269 54
yafD,yafD-yafE 0.269 55
ydcO 0.264 56
ydcN,ydcN-ydcP 0.264 57
hofQ 0.262 58
dppF-dppD-dppC-dppB-dppA,dppA,dppC-dppB-dppA 0.259 59
pgk,fbaA-pgk,mscS-fbaA-pgk 0.258 60
yjbQ-yjbR 0.257 61
ibaG-mlaB-mlaC-mlaD-mlaE 0.256 62
ybdN 0.255 63
ygiS-ygiT-mqsR,ygiT-mqsR 0.255 64
ygiT 0.255 65
yhaH 0.252 66
ygbN 0.251 67
cpxA-cpxR 0.251 69
cpxQ 0.251 69
fieF-pfkA,fieF 0.251 69
infB-nusA 0.249 71
infB-nusA-rimP,nusA-rimP 0.249 72
preT-preA 0.248 73
ansP 0.248 74
yncG 0.248 75
yrhA 0.245 76
pptA 0.244 77
yncC 0.244 78
ndh 0.243 79
dsdX-dsdA 0.243 80
dsdC 0.243 81
tpr-tyrV-tyrT-purU-ychJ-rttR,tyrV-tyrT-purU-ychJ,ychJ 0.242 82
wbbL 0.239 83
malQ-malP,malP 0.237 84
galP 0.237 85
eutA-eutH 0.234 86
nagK-cobB 0.233 87
ygbI 0.233 88
ygbJ-ygbK,ygbJ-ygbK-ygbL-ygbM 0.233 88
ynjI 0.232 90
ydcC 0.232 91
yfjL,yfjK-yfjL 0.229 92
plsB 0.226 93
dgkA,dgkA-lexA 0.226 94
rluB 0.224 95
fliE 0.221 96
fliF-fliG-fliH-fliI-fliJ-fliK 0.221 96
ytfF 0.219 98
ompA 0.219 99
fabA-ycbZ,ycbZ 0.219 100
matP 0.219 100
bluF 0.218 102
ycgZ-ymgA-ariR-ymgC,ycgZ 0.218 102
ymgA-ariR 0.218 104
lipA 0.218 105
ybiJ-ybiI-ybiX-ybiL,ybiI-ybiX-ybiL,ybiL 0.217 106
yniD 0.214 107
mog 0.213 108
yobB-exoX 0.210 109
kdpC-kdpB-kdpA-kdpF 0.207 110
ybfA 0.207 111
pdxH-mliC-anmK,anmK,mliC-anmK 0.207 112
slyB 0.207 112
yqeI-yqeJ 0.203 114
yfgM-hisS-ispG,ispG-sroE 0.202 115
cpxP 0.200 116
ycgR 0.198 117
ymgE 0.198 117
fumB-dcuB 0.198 119
yecC3p 0.196 120
uvrC 0.196 121
rlmM 0.195 122
rlmM-ygdD,ygdD 0.195 123
hha-tomB 0.195 124
prc-proQ-msrC,msrC 0.195 125
yebS-yebT 0.195 126
yahV 0.194 127
folA 0.194 128
ycbK-ycbL 0.193 129
ybbN-ybbO 0.193 130
yiaD 0.192 131
bisC 0.192 132
ygiN 0.191 133
ompL 0.189 134
ybdF,nfsB-ybdF 0.188 135
ybdJ 0.188 136
aidB 0.187 137
hisS-ispG-yfgA,yfgA 0.187 138
rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV-rpsS-rplB,rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV-rpsS-rplB 0.186 139
waaZ-waaY 0.185 140
lipB 0.185 141
lipB-ybeD,ybeD 0.185 142
yifN 0.184 143
rep 0.184 144
ilvA 0.183 145
ygjQ 0.183 146
ylaB 0.182 147
nanR 0.180 148
dcuD 0.180 149
fecA-fecR-fecI,fecR-fecI 0.180 150
ykiE 0.180 151
insA-7 0.180 151
yaiS 0.180 153
panC 0.178 154
nc3 0.176 155
sokC 0.175 156
lnt-ybeX,ybeX 0.175 157
yhiJ 0.175 158
ynaE 0.173 159
ynaM 0.173 160
yehE 0.172 161
ytgA 0.171 162
pepA,holC-pepA 0.171 163
lptF,lptF-lptG 0.171 163
gsk 0.171 165
yiiE 0.169 166
leuD-leuC-leuB-leuA-leuL,leuL 0.169 167
leuB-leuA 0.169 168
aes 0.167 169
ymgK 0.167 170
ymgL 0.167 171
thrU-tyrU-glyT-thrT-tufB-secE-nusG-rplK,thrU-tyrU-glyT-thrT-tufB-secE-nusG,thrU-tyrU-glyT-thrT-tufB 0.166 172
coaA 0.166 173
mtr-deaD,deaD 0.165 174
deaD-yrbN,yrbN 0.165 174
yajQ 0.165 176
yajL-panE 0.165 177
thiH-thiG-thiF-thiE-thiC-thiS,thiE-thiC,thiF-thiE-thiC-thiS 0.165 178
rseC-rseB-rseA,rseA 0.164 179
insF-2-insE-2-insEF2 0.164 180
yiiF 0.163 181
uspE-fnr,fnr 0.163 182
rhsD-ybbC-rhsH-ybbD 0.163 183
yeiR-lpxT 0.162 184
mdfA 0.162 185
deoR-ybjG,ybjG 0.162 186
zwf 0.162 187
yebK-pykA,yebK 0.162 187
ydfK-ynfT 0.161 189
allR,allR-gcl-hyi 0.160 190
maa-hha 0.159 191
ariR 0.158 192
ydcR 0.157 193
leuO 0.157 194
yadG-yadH-yadI,yadG-yadH 0.156 195
can 0.156 196
ycfZ-ymfA 0.156 197
rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC,rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC 0.156 198
rpsH-rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV,rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV,rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV 0.156 198
feoA-feoB-feoC 0.156 200
uxuR 0.155 201
lrhA 0.154 202
nuoN-nuoM-nuoL-nuoK-nuoJ-nuoI-nuoH-nuoG-nuoF-nuoE-nuoC-nuoB-nuoA,nuoE-nuoC-nuoB-nuoA,nuoC-nuoB-nuoA,nuoB-nuoA 0.153 203
ygdI 0.153 204
csdA-csdE 0.153 205
dsbD-cutA-dcuA,cutA-dcuA,dcuA 0.152 206
aat 0.152 207
alaA-yfbR,alaA 0.152 208
ansA-pncA 0.152 209
fabZ-lpxA-lpxB,fabZ-lpxA-lpxB-rnhB,fabZ-lpxA,fabZ 0.151 210
yhjE 0.151 211
hns 0.151 212
pmrD 0.150 213
clpB 0.150 214
yqjE-yqjK 0.150 215
iscA-iscU-iscS 0.150 216
yaiY 0.149 217
yaiZ 0.149 217
ygiL 0.148 219
rne 0.147 220
yceQ 0.147 221
yeiQ 0.147 222
ttdR 0.147 223
ttdA-ttdB-ttdT 0.147 223
yffL 0.146 225
yfdY 0.144 226
lpxP 0.144 226
paaZ 0.144 228
paaA-paaB-paaC-paaD-paaE-paaF-paaG-paaH-paaI-paaJ-paaK 0.144 229
rraA 0.143 230
yqeF 0.142 231
yqeG 0.142 231
ptsG 0.141 233
yibX 0.141 234
yibY 0.141 234
modA-modB-modC,modA 0.140 236
modF-modE,modE 0.140 237
rem 0.139 238
recQ,recQ-rhtC 0.139 239
ykgL 0.139 240
matA 0.139 241
gadY 0.138 242
gltA 0.137 243
ybgV 0.137 244
ybgU 0.137 245
sdhC-sdhD-sdhA-sdhB,sdhC-sdhD-sdhA-sdhB-sucA-sucB-sucC-sucD-sdhX 0.137 246
emrD 0.137 247
ysdE 0.137 248
ythA 0.137 249
yjhE 0.137 250
rnpB-garK-garR-garL-garP 0.137 251
garD 0.137 252
ymiA-yciX 0.136 253
aldA 0.136 254
micC 0.136 255
ompN 0.136 256
ydeO 0.135 257
nmpC 0.135 258
umpH 0.135 259
aer 0.135 260
patA 0.135 260
ymgJ 0.134 262
ymgI 0.134 263
ymgD-ymgG 0.134 264
bamA,bamA-skp,bamA-skp-lpxD-fabZ-lpxA-lpxB-rnhB-dnaE 0.133 265
insH-10 0.132 266
yhcF 0.132 266
yhdU 0.132 268
yciS-yciM,yciS-yciM-pyrF-yciH 0.131 269
murA 0.130 270
ypdA-ypdB-ypdC 0.129 271
alaC 0.129 272
yraH 0.128 273
yhhH 0.127 274
ompG 0.127 275
patD 0.126 276
yaiX 0.126 277
ybgE-cydX 0.125 278
yadS-btuF-mtn,mtn 0.125 279
dgt 0.125 280
hslV-ftsN,hslU-hslV-ftsN 0.123 281
kefB-kefG-yheV,kefG 0.123 282
yheS-yheT-yheU-prkB,yheS-yheT-yheU 0.123 282
dksA,pcnB-gluQ-dksA,gluQ-dksA 0.123 284
ymfI 0.123 285
rihB 0.122 286
yeiL 0.122 286
essD-rrrD-rzpD 0.122 288
ydgH,ydgH-ydgI-folM 0.121 289
pntB-pntA 0.121 290
ydeO-safA 0.121 291
ahpC,ahpC-ahpF 0.121 292
dsbG 0.121 293
yjcE 0.121 294
yqhJ 0.121 295
yqcG 0.121 296
queE 0.121 297
ygcG 0.121 297
intF 0.121 299
ygaU 0.120 300
ygaV-ygaP 0.120 300
yqaE,ygaU-yqaE 0.120 302
yhiM 0.120 303
yhiL 0.120 304
yjiJ 0.120 305
fimA-fimI-fimC,fimA,fimA-fimI-fimC-fimD-fimF-fimG-fimH 0.119 306
yjbD-lysC,lysC 0.118 307
yqfI 0.117 308
gcvH-gcvT,gcvP-gcvH-gcvT 0.117 309
ydjE 0.117 310
degP 0.117 311
pagP 0.117 312
trxC 0.117 313
yfiF 0.117 314
yobD 0.116 315
apaH-apaG-rsmA-pdxA-surA,surA,rsmA-pdxA-surA 0.116 316
lit 0.116 317
fliY-fliZ-fliA 0.115 318
acrE-acrF 0.114 319
gadW 0.113 320
ada-apbE-ompC,ompC 0.113 321
ddlA 0.113 322
iraP-phoA,iraP 0.113 323
ybiJ 0.112 324
csrA,argZ-argY-argV-serV-csrA 0.112 325
frc 0.112 326
dacB 0.111 327
rlmE-greA,greA 0.111 328
yoaH 0.111 329
pabB-nudL 0.111 330
rssB-galU,rssB 0.111 331
yahB 0.110 332
intR-ydaQ-ydaC-ralR-recT-recE 0.110 333
racC 0.110 334
yghR-yghS 0.110 335
yghT 0.110 335
der-bamB 0.110 337
hslJ 0.107 338
phoH 0.107 339
astE-astB-astD-astA-astC 0.107 340
xthA 0.107 340
nei 0.106 342
phoA-psiF 0.106 343
ytfF-qorB,qorB 0.105 344
ytfH 0.105 345
cspI 0.105 346
pyrF-yciH 0.105 347
yfcJ 0.105 348
yaiL 0.104 349
yidL 0.103 350
yidJ-yidK 0.103 351
yhhZ-insA-6-insB-6-insAB6 0.102 352
aspC-ompF,ompF 0.102 353
tldD 0.102 354
ycbJ 0.102 355
hdhA,uidR-hdhA 0.102 356
yfhG 0.100 357
dnaJ-insL-1 0.100 358