Top Promoters Bound by arsR

On this page you can access the list of promoter regions bound by arsR. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs)	Scores	Ranks

yhcN	1.000	1
tdk	0.785	2
mtgA-elbB	0.738	3
arcZ	0.738	4
cbpM-cbpA	0.659	5
yccE	0.659	5
ydcZ-mnaT	0.616	7
curA	0.616	7
lomR	0.606	9
btuC-ihfA,ihfA	0.574	10
btuD-btuE-btuC,btuE-btuC	0.574	11
rzoD	0.560	12
ygjI	0.533	13
yjjA-dnaC-dnaT,dnaC-dnaT	0.524	14
ushA	0.523	15
ydeR-ydeS-ydeT	0.520	16
fsr	0.520	17
nikA-nikB-nikC-nikD,nikA-nikB-nikC-nikD-nikE-nikR	0.503	18
yecN-cmoA-cmoB	0.490	19
yoaH	0.472	20
ykfJ-prfH	0.471	21
mfd	0.468	22
fhuE	0.449	23
hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ,hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ-ycfP	0.449	24
ydhT-ydhU-ydhX	0.426	25
rstA-rstB,rstA-rstB-tus	0.394	26
ydgC	0.394	27
mrcB	0.390	28
agrB	0.387	29
arsR-arsB-arsC	0.387	30
yeiL	0.385	31
rihB	0.385	32
nc3	0.382	33
alaE	0.382	34
insL-1	0.380	35
clpX-lon,clpX	0.379	36
lpxM	0.372	37
ybjO-rlmC	0.370	38
leuZ-cysT-glyW-pgsA,pgsA	0.366	39
gpp-rhlB,rhlB	0.359	40
trxA-rhoL-rho,trxA-rhoL-rho-wecA,trxA	0.359	40
tnaB	0.351	42
yjgA	0.350	43
pmbA	0.350	44
ydeO-safA	0.349	45
yhhM	0.347	46
yhhN,yhhN-zntA	0.347	47
rhoL-rho,rhoL-rho-wecA,rhoL-rho-wecA-wzzE,rhoL	0.344	48
rnhA,gloB-rnhA	0.340	49
yfbU-yfbV,yfbV	0.339	50
ackA,ackA-pta	0.339	50
nudE	0.339	52
yrfF	0.339	52
yfgJ	0.337	54
yhjK	0.337	55
add	0.330	56
ybgE-cydX	0.327	57
ybgC-tolQ-tolR-tolA,ybgC-tolQ-tolR-tolA-tolB	0.327	58
speD	0.324	59
yhhY	0.320	60
yhhW-yhhX,yhhX	0.320	61
tatD	0.317	62
yjdF	0.315	63
puuC-puuB-puuE	0.308	64
preT-preA	0.307	65
yqiD	0.306	66
glcB-glcG	0.303	67
alpA	0.301	68
yfjH	0.301	69
lacI	0.296	70
gpt-frsA,gpt	0.289	71
ycfP	0.286	72
yhhI	0.284	73
gmhA,gmhA-yafJ	0.281	74
fadE	0.281	75
ynaE	0.275	76
ydfK-ynfT	0.275	76
ynaM	0.275	78
lysP	0.271	79
potF-potG-potH,potF-potG,potF-potG-potH-potI	0.268	80
yncO	0.266	81
yncI	0.266	82
cbdA-cbdB-appA-cbdX	0.265	83
lfhA	0.264	84
ykgV	0.264	85
yagN	0.264	86
ybiX	0.264	87
katG,katG-yijE	0.264	88
pfkA	0.263	89
fpr-glpX,glpX	0.257	90
yceH	0.256	91
ftsZ,ftsZ-lpxC-secM,ftsZ-lpxC	0.256	92
phr	0.255	93
ybgA-phr	0.255	94
lrhA	0.255	95
ymfD-ymfE	0.254	96
lit	0.254	96
gltP	0.252	98
dsdA	0.250	99
yeiB-folE,folE	0.249	100
yeiG	0.249	101
ygeF	0.248	102
yqeL	0.248	103
yqeK	0.248	103
fimA3p	0.245	105
ydhT-ydhU-ydhX-ydhW-ydhV-ydhY,ydhW-ydhV-ydhY	0.243	106
nlpA	0.243	107
yicS	0.243	107
araG-araF-araH	0.242	109
yraP	0.240	110
yceF	0.239	111
yceD-rpmF-plsX-fabH-fabD,yceD-rpmF-plsX-fabH,yceD-rpmF	0.239	112
sraB	0.239	113
adeP	0.238	114
yieH	0.238	114
hspQ-rlmI,rlmI	0.237	116
cedA	0.237	117
katE	0.237	118
gpsA-secB,cysE-gpsA-secB	0.235	119
rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM-rpmJ	0.234	120
zntR-yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM	0.234	121
cho	0.232	122
spy3p	0.232	123
insI-1-insN-eyeA	0.231	124
yfcZ	0.227	125
fadL	0.227	126
intD	0.227	127
xisD	0.227	128
rplL	0.227	129
ybeF	0.226	130
acrR	0.225	131
ypfH-tmcA-ypfJ,tmcA-ypfJ,ypfJ	0.225	132
yeiI	0.225	133
ssb	0.222	134
uvrA	0.222	135
ythA	0.221	136
kefF-kefC,kefF-kefC-folA	0.219	137
ydcF,ydcF-aldA	0.217	138
ryfD	0.216	139
clpB	0.216	140
cvrA	0.215	141
ybjP	0.215	142
ybjQ-amiD	0.215	142
wecF	0.213	144
pflA	0.212	145
yniC	0.212	146
yniB	0.212	147
trkA	0.211	148
yeeL	0.209	149
shiA-amn,shiA	0.209	149
ves	0.206	151
ygbF-ygbT-casE-casD	0.205	152
actP-yjcH-acs,acs	0.204	153
nrfA-nrfB-nrfC-nrfD,nrfA-nrfB-nrfC-nrfD-nrfE-nrfF-nrfG	0.204	154
dnaJ-insL-1	0.202	155
tdcF-tdcE-tdcD-tdcC-tdcB-tdcG	0.200	156
hpt,hpt-yadG-yadH,hpt-yadG-yadH-yadI	0.200	157
gcd	0.200	158
ybiV	0.200	159
guaD-ghxQ	0.200	160
ybdM	0.199	161
yhaI	0.199	162
yhiJ	0.199	163
pgk-epd,fbaA-pgk-epd	0.199	164
mipA	0.198	165
yeaG-yeaH	0.198	166
yeaK-yeaL,yeaK	0.198	167
ecpA	0.197	168
yibX	0.196	169
yibY	0.196	169
dusC	0.196	171
ykgD	0.196	172
rayT	0.195	173
apt,apt-dnaX-ybaB	0.194	174
ybaM-priC	0.194	175
glmS	0.193	176
yciA-yciB-yciC,yciB-yciC	0.193	177
ompW	0.193	177
purN,purN-ppk	0.192	179
leuO	0.190	180
micL	0.190	181
ileY	0.188	182
ygaQ	0.188	183
mnmH,ylbG-mnmH	0.188	184
yzgL	0.186	185
ymdF	0.186	186
garD	0.185	187
rnpB-garK-garR-garL-garP	0.185	188
hemN	0.185	189
gltW-rrsG,rrsG,rrfG-rrlG-gltW-rrsG	0.185	190
artJ	0.184	191
malX-malY	0.183	192
malI	0.183	193
zapB	0.183	194
glpX-glpK-glpF,glpK-glpF	0.183	195
mngR	0.182	196
mngA-mngB	0.182	197
yneM	0.181	198
mgtT	0.181	198
secM-secA-mutT,secM-secA,secM	0.181	200
aroD-ydiF,aroD	0.179	201
yccJ-wrbA	0.178	202
cysC-cysN-cysD,ftsB-ygbE-cysC-cysN-cysD	0.177	203
iap	0.177	203
pptA	0.177	205
yjcE	0.177	206
yniA	0.177	207
citT	0.176	208
ydgD	0.176	209
adiY	0.175	210
glnQ-glnP-glnH,glnH	0.174	211
ydeA	0.172	212
ybhH	0.172	213
mpaA	0.170	214
mpaA-ymjC	0.170	215
aceE-aceF	0.170	216
baeS-baeR	0.170	217
nepI	0.170	218
fecB,fecC-fecB	0.170	219
queF,queF-ygdH	0.169	220
syd	0.169	221
purK-purE	0.167	222
ygeA-araE,araE	0.166	223
ybdO	0.166	224
ybfL	0.166	225
ylcH	0.165	226
ybcN-ninE-ybcO-rusA-ylcG	0.165	226
rpmJ-secY-rplO-rpmD-rpsE-rplR-rplF	0.165	228
rpmJ-secY-rplO-rpmD-rpsE-rplR-rplF-rpsH,rplO-rpmD-rpsE-rplR-rplF-rpsH	0.165	229
otsA	0.165	230
ridA-pyrI-pyrB	0.164	231
ridA-pyrI-pyrB-pyrL	0.164	231
amiA-hemF	0.164	233
yhgE	0.164	234
pck	0.164	235
pheP	0.163	236
rybB	0.162	237
lysU	0.162	238
yehF	0.161	239
ybfQ	0.161	240
ykgA	0.161	241
yehR	0.160	242
ygbI	0.158	243
ygbJ-ygbK,ygbJ-ygbK-ygbL-ygbM	0.158	244
yfgF	0.158	245
yfgG	0.158	245
IS129	0.158	248
pbpC-yfhM	0.158	248
sseA	0.158	248
fsaA	0.158	250
ybiW-ybiY	0.158	251
thiD-thiM-rcnR,rcnR	0.158	252
rcnA-rcnB	0.158	253
yajD	0.157	254
ymgF	0.157	255
gpmM-envC,gpmM-envC-yibQ,gpmM	0.157	256
cysE-gpsA-secB-grxC,grxC	0.157	257
emrY-emrK	0.154	258
csrA,argZ-argY-argV-serV-csrA	0.154	259
nupG	0.154	260
tyrA-aroF	0.153	261
yfiR-yfiN-yfiB,yfiR-yfiN	0.153	262
rcsA	0.153	263
puuP-ymjE	0.152	264
yzfA	0.152	265
chpS-chpB	0.152	266
ybfD	0.151	267
ruvC	0.150	268
yodE	0.149	269
ryeG	0.149	269
yafN-yafO-yafP	0.148	271
yhiN	0.148	272
yidF	0.148	273
ydeM-ydeN,ydeN	0.147	274
yieK-yieL-bglH	0.147	275
ychN	0.147	276
ychO	0.147	276
rssA,rssA-rssB,rssA-rssB-galU	0.146	278
tpr-tyrV-tyrT-purU-ychJ-rttR,tyrV-tyrT-purU-ychJ,ychJ	0.146	279
tyrT-purU,purU	0.146	280
ylcI	0.146	281
nohD	0.146	281
ygiZ	0.146	283
mdaB,mdaB-ygiN	0.146	284
macA-macB	0.145	285
ybjX	0.145	286
mltD	0.145	287
argU	0.144	288
bglA	0.144	289
yqfB	0.144	290
ygeG	0.144	291
pgpA	0.144	292
ykgJ	0.143	293
feaR	0.143	294
feaB	0.143	295
ompA	0.142	296
ykgP	0.142	297
eaeH-insE-1-insF-1-insEF1	0.142	298
adeQ	0.142	299
adeD	0.142	299
yihI,yihI-hemN	0.142	301
yihA	0.142	302
csrC	0.142	302
ydeP	0.141	304
tam	0.141	305
gcl-hyi-glxR-ybbW-allB-ybbY-glxK	0.141	306
amyA	0.140	307
gspB-gspA	0.140	308
gspC-gspD-gspE-gspF-gspG-gspH-gspI-gspJ-gspK-gspL-gspM-gspO	0.140	308
yjjP	0.140	310
fumB-dcuB	0.138	311
yljB	0.138	312
clsC	0.138	313
ybhA	0.138	314
pgl	0.138	314
yneL-hipA-hipB,hipA-hipB	0.138	316
mdtP-mdtO-mdtN	0.137	317
yneG-glsB	0.136	318
sfsB	0.136	319
accD,cvpA-dedD-folC-accD,dedD-folC-accD	0.136	320
gltF	0.136	321
yjfI-yjfJ	0.135	322
uspA	0.135	323
yobI	0.135	324
ruvB-ruvA	0.135	325
yebB	0.135	325
lacA-lacY	0.135	327
ftsX-ftsE-ftsY	0.134	328
rsmD-yhhL,rsmD-yhhL-yhhN	0.134	329
ghoS-ghoT	0.134	330
nanS-nanM-nanC,nanM-nanC,nanC	0.133	331
dcuR-dcuS	0.132	332
yjdI-yjdJ	0.132	333
glnE-ygiF	0.132	334
ygiM,ygiM-cca	0.132	334
ygfM-xdhD	0.132	336
yedV-yedW,yedW	0.132	337
hiuH,hiuH-yedY-yedZ,hiuH-yedY-yedZ-zinT	0.132	338
ydaG-ydaF	0.132	339
oxc	0.132	340
pspB-pspC-pspD-pspE,pspB-pspC-pspD	0.131	341
mdtL	0.131	342
ybhM	0.130	343
bssS	0.130	344
nudG-gdhA,nudG	0.130	345
ynjF	0.130	346
glmS-glmU	0.130	347
fmt-rsmB	0.129	348
pdxH-mliC-anmK,anmK,mliC-anmK	0.128	349
slyB	0.128	350
ssuB-ssuC-ssuD-ssuA-ssuE	0.128	351
elfA	0.128	351
yjgR	0.128	353
tnaC,tnaC-tnaA	0.127	354
fixA-fixB-fixC,fixA-fixB-fixC-fixX	0.127	355
caiE-caiD-caiC-caiB-caiA-caiT	0.127	356
ubiF	0.127	357
ybeX-ybeY-ybeZ-miaB,ybeY-ybeZ-miaB,miaB	0.127	358
fre	0.127	359
sdaA,sdaA-yoaD	0.127	360
rcnB	0.126	361
mngB	0.126	362
yfjD	0.126	363
nrdG-nrdD	0.126	364
ubiX	0.126	365
ycbK-ycbL	0.125	366
ydhR	0.125	367
acnB,acnB-yacL	0.124	368
ydfJ	0.123	369
yfhG	0.122	370
tabA	0.122	371
recF-dnaN	0.121	372
yqeF	0.121	373
yqeG	0.121	374
potE-speF-speFL	0.121	375
truD,pcm-umpG-truD	0.121	376
dtpA	0.121	377
livJ	0.121	378
yhcE	0.121	379
ubiX-purF-cvpA,purF-cvpA	0.120	380
cysM-cysA-cysW-cysU-cysP,cysA-cysW-cysU-cysP	0.120	381
yjgH	0.120	382
icdC	0.120	383
nhaR	0.119	384
ypjB	0.118	385
fecA-fecR-fecI,fecR-fecI	0.118	386
insA-7	0.118	386
ykiE	0.118	388
ydcC	0.117	389
ybeT	0.117	390
ybeU-djlC	0.117	390
fic-yhfG-ppiA,yhfG-ppiA,ppiA	0.116	392
tsgA	0.116	392
evgA-evgS,evgA	0.116	394
evgL	0.116	395
csiR	0.116	396
menE-menC-menB	0.116	397
nc2	0.116	398
hemH	0.116	399
elfD-elfC-elfG-ycbU-ycbV-ycbF	0.116	400
caiC-caiB,caiB	0.116	401
creD	0.115	402
yaiV	0.115	403
exuR	0.115	404
atpG-atpA-atpH-atpF,atpA-atpH-atpF	0.115	405
ydjO	0.115	406
ligA-zipA-ypeB,ligA-zipA,zipA	0.114	407
cysZ,cysZ-cysK	0.114	408
ratB-ratA	0.113	409
smpB-ssrA,smpB	0.113	410
qseB-qseC	0.113	411
ygiV	0.113	412
ygjJ-ygjK	0.113	413
yahM	0.113	414
yihL-yihM-yihN,yihL-yihM	0.113	415
xanP-yicH,xanP	0.112	416
gltS	0.112	417
chbR	0.112	418
tmk-holB-ycfH	0.111	419
rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV-rpsS-rplB,rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV-rpsS-rplB	0.110	420
kdgT	0.109	421
murB-birA	0.109	422
bluF	0.109	423
ycgZ-ymgA-ariR-ymgC,ycgZ	0.109	423
ybfH	0.109	425
ybiT	0.109	426
ldtB	0.109	427
yfeX	0.109	428
ydbD	0.109	429
yhaH	0.108	430
kdsC-lptC,kdsC-lptC-lptA-lptB	0.108	431
yggC-yggD-yggF-cmtA-cmtB-yggP	0.107	432
dtd-yiiD	0.107	433
proK	0.106	434
recC-ppdC-ygdB-ppdB-ppdA	0.106	435
tusA	0.106	436
tldD	0.106	437
hemF	0.106	438
ygdR	0.106	439
sodB	0.105	440
ygiS	0.105	441
ypjA	0.105	442
yibH-yibI	0.105	443
mglC-mglA-mglB,mglA-mglB	0.105	444
allB	0.104	445
insD-2-insC-2-insCD2	0.104	446
rihC,rihC-dapB	0.104	447
deoD	0.104	448
hisP-hisM-hisQ-hisJ	0.104	449
ispB	0.104	450
yjhB-yjhC	0.103	451
insG	0.103	452
htpX	0.102	453
ybaN-apt,ybaN	0.102	454
queE	0.101	456
yqcG	0.101	456
ygcG	0.101	456
yceB-grxB,grxB	0.101	458