Top Promoters Bound by cynR

On this page you can access the list of promoter regions bound by cynR. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs)	Scores	Ranks

yhiN	1.000	1
ygeH	0.626	2
psuG-psuK	0.563	3
yceI-yceJ	0.522	4
nrdA-nrdB-yfaE	0.504	5
yfaL	0.504	6
prlF-yhaV	0.459	7
csiE	0.430	8
ynbG	0.402	9
ydbA	0.402	9
ygcU	0.399	11
iraD-idlP	0.397	12
iraD-ytiD-idlP	0.397	13
yjiC	0.397	14
ytiC	0.397	14
yedJ-yedR	0.391	16
rseX	0.391	16
yedS	0.391	18
tynA	0.357	19
cynR	0.348	20
cynT-cynS,cynT-cynS-cynX	0.348	21
metR	0.343	22
metE	0.343	22
ybeR-djlB	0.339	24
yhdV	0.337	25
yaaX	0.329	26
aceB-aceA-aceK,aceB-aceA	0.327	27
ydgH,ydgH-ydgI-folM	0.327	28
pntB-pntA	0.327	29
hemB	0.326	30
yaiT	0.326	30
mnmG-mioC-asnC,mioC-asnC,asnC	0.324	32
asnA	0.324	33
yegW	0.311	34
eutM-eutD-eutT-eutQ-eutP-eutS	0.306	35
gcvH-gcvT,gcvP-gcvH-gcvT	0.300	36
yqfI	0.300	36
yjhU	0.293	38
aslB	0.291	39
ompA	0.283	40
iraM	0.282	41
mntP	0.275	42
ydaG-ydaF	0.275	43
ybjX	0.272	44
macA-macB	0.272	45
yjjQ-bglJ	0.271	46
yjjP	0.271	47
hflD-mnmA-nudJ	0.271	48
yicI-yicJ	0.257	49
cyoD-cyoC-cyoB-cyoA,cyoE-cyoD-cyoC-cyoB-cyoA	0.255	50
rrsA-ileT,rrsA,rrsA-ileT-alaT-rrlA-rrfA,rrsA-ileT-alaT	0.252	51
yhiM	0.250	52
yhiL	0.250	53
prc-proQ-msrC,msrC	0.248	54
yebS-yebT	0.248	55
alaE	0.245	56
stpA	0.245	57
yqeH	0.241	58
yiaA	0.240	59
elfA	0.235	60
ssuB-ssuC-ssuD-ssuA-ssuE	0.235	61
fimE	0.234	62
ybgD	0.233	63
yhcA-yhcD	0.231	64
ybgV	0.231	65
sdhC-sdhD-sdhA-sdhB,sdhC-sdhD-sdhA-sdhB-sucA-sucB-sucC-sucD-sdhX	0.231	66
gltA	0.231	67
ybgU	0.231	67
helD	0.230	69
ykgR	0.230	70
ykgM-ykgO	0.230	71
ppc	0.228	72
ydiE	0.223	73
yhbX	0.220	74
fecA-fecR-fecI,fecR-fecI	0.220	75
insA-7	0.220	76
ykiE	0.220	77
araJ	0.219	78
fdrA-ylbF-ybcF-ylbE	0.216	79
allE-allC-allD	0.216	80
adiY	0.215	81
racR	0.213	82
ydaS-ydaT-ydaU-ydaV-ydaW-rzpR	0.213	82
yfjH	0.212	84
alpA	0.212	85
ybcL-ybcM	0.212	86
ybdK	0.211	87
sokE	0.211	88
hokE	0.211	89
borD	0.209	90
narG,narG-narH-narJ-narI	0.209	91
yaiX	0.208	92
yfcC	0.208	93
yggC-yggD-yggF-cmtA-cmtB-yggP	0.207	94
ynfL	0.206	95
ynfM	0.206	96
wcaB-wcaA-wzc-wzb-wza	0.205	97
yegH	0.205	98
gadX,gadW-gadX	0.200	99
gadE-gadF,gadE-mdtE-mdtF-gadF	0.198	100
arrS	0.198	101
yfcV	0.197	102
yjeJ	0.197	103
pdxH-mliC-anmK,anmK,mliC-anmK	0.196	104
slyB	0.196	104
elfD-elfC-elfG-ycbU-ycbV-ycbF	0.196	106
ampG-yajG,yajG	0.194	107
bolA	0.194	107
apaH-apaG	0.192	109
acpP-fabF-pabC,acpP,acpP-fabF-pabC-yceG,acpP-fabF	0.191	110
ydhZ	0.190	111
pykF	0.190	112
yciI	0.189	113
tonB	0.189	113
sdiA	0.188	115
sdsN	0.188	116
yfjJ	0.187	117
xdhA-xdhB-xdhC,xdhA-xdhB	0.185	118
allR,allR-gcl-hyi	0.185	119
pitB	0.184	120
proS-tsaA-rcsF,tsaA-rcsF	0.181	121
selC	0.180	122
yjcF	0.179	123
yccJ-wrbA	0.177	124
ymdF	0.177	124
cspC-yobF	0.176	126
hda-uraA-upp,uraA-upp,upp	0.174	127
purM-purN	0.174	127
yhjE	0.173	129
ymgL	0.172	130
ymgK	0.172	131
cspD	0.170	132
clpS,clpS-clpA	0.170	132
clpA	0.170	134
kefF-kefC,kefF-kefC-folA	0.168	135
yjfI-yjfJ	0.168	136
dsbA	0.167	137
napC-napB-napH-napG-napA-napD-napF,ccmH-dsbE-ccmF-ccmE-ccmD-ccmC-ccmB-ccmA-napC-napB-napH-napG-napA-napD-napF,napA-napD-napF	0.166	138
eco	0.166	139
fabF	0.165	140
gspC-gspD-gspE-gspF-gspG-gspH-gspI-gspJ-gspK-gspL-gspM-gspO	0.164	141
gspB-gspA	0.164	142
sfmC-sfmD	0.163	143
dauA-prsA-ispE-lolB,prsA-ispE-lolB	0.163	144
hemA,hemA-prfA-prmC	0.163	144
adiA	0.162	146
yafK-yafQ-dinJ,yafQ-dinJ	0.162	147
yafL	0.162	147
proY	0.161	149
yqfH	0.161	150
idi	0.161	151
deoD	0.161	152
wecA-wzzE-wecB-wecC-rffG-rffH-wecD-wecE-wzxE-wzyE-wecG-wecF,wecA-wzzE,wecA-wzzE-wecB	0.160	153
mepS	0.160	154
yphD-yphE-yphF	0.160	155
ygbA	0.159	156
mutS-pphB,mutS	0.159	156
yjdM	0.159	158
crfC-yjcZ	0.159	158
yjjM,lgoT-yjjM	0.158	160
lgoD	0.158	161
ybeF	0.156	162
ygiL	0.155	163
nc4	0.154	164
yhhZ-insA-6-insB-6-insAB6	0.154	165
srlR,srlR-srlQ	0.153	166
ddlA	0.151	167
iraP-phoA,iraP	0.151	168
alaC	0.151	169
ypdA-ypdB-ypdC	0.151	169
xapR	0.150	171
insH-2-nmpC,insH-2	0.150	172
yadN	0.149	173
rhsE-ydcD	0.148	174
ylcH	0.148	175
mppA	0.147	176
fnrS	0.145	177
ynaL	0.145	178
spf	0.144	179
dapD-glnD,glnD	0.144	180
adeQ	0.143	181
adeD	0.143	181
ygeF	0.143	183
phoU-pstB-pstA-pstC-pstS,pstB-pstA-pstC-pstS,pstA-pstC-pstS,pstS	0.143	184
roxA	0.142	185
wecH	0.142	186
ysaB	0.142	187
waaU-waaZ	0.141	188
yqeK	0.141	189
fumA,fumC-fumA	0.141	190
manA,manA-ydgA	0.141	191
yjtD	0.140	192
arcA	0.140	193
yneO	0.139	194
kduI	0.139	195
leuO	0.139	196
eptA,basS-basR-eptA	0.138	197
yeeN	0.137	198
appY	0.136	199
yiiX-metJ,metJ	0.136	200
metB-metL	0.136	201
yggC-yggD,epd-yggC-yggD	0.136	202
cadC	0.135	203
yacG-zapD-coaE	0.134	204
yacM	0.134	205
guaC	0.134	206
glpX-glpK-glpF,glpK-glpF	0.133	207
zapB	0.133	208
folX-yfcH	0.132	209
ytfB	0.131	210
fklB,fklB-cycA	0.131	211
ompT	0.131	212
metK	0.130	213
yqgG	0.130	214
yqgD	0.130	215
och5	0.130	216
yfbM	0.130	217
aspC-ompF,ompF	0.129	218
yraH	0.129	219
ychF-pth	0.129	220
ychH	0.129	220
dedA-truA-usg	0.128	222
yjfY	0.128	223
rpsF-priB-rpsR-rplI	0.128	223
yjiT	0.128	225
ybdN	0.128	226
yjgM	0.128	227
yjgN	0.128	227
rcsA	0.128	229
ghrB	0.127	230
ydiY	0.127	231
pfkB-ydiZ-yniA,pfkB	0.127	231
ygfI-yggE-argO,argO	0.123	233
cpxQ	0.122	234
fieF-pfkA,fieF	0.122	234
yieH	0.122	236
adeP	0.122	237
wbbL	0.121	238
diaA-yraP,diaA	0.121	239
ycaD	0.120	240
ycaC	0.120	241
yfjW	0.120	242
citG-citX-citF-citE-citD-citC	0.120	243
citA-citB	0.120	243
mscL	0.120	245
ynfE-ynfF-ynfG-ynfH-dmsD	0.119	246
xylE	0.119	247
aaeB-aaeA-aaeX	0.118	248
aaeR	0.118	249
glyS-glyQ	0.118	250
ibpB	0.117	251
yagL-yagM	0.117	252
yihA	0.116	253
csrC	0.116	254
gcd	0.116	255
hpt,hpt-yadG-yadH,hpt-yadG-yadH-yadI	0.116	256
ydeI	0.113	257
ydeJ	0.113	258
ydfK-ynfT	0.112	259
yddJ-yddK-yddL	0.112	260
elyC	0.111	261
yehR	0.111	262
ybeQ	0.111	263
gltS	0.111	264
rluB	0.110	265
nanR	0.110	266
dcuD	0.110	266
ycaM	0.110	268
lgt-ptsP-rppH,ptsP-rppH	0.110	269
yneL	0.110	270
ygaU	0.109	271
yqaE,ygaU-yqaE	0.109	272
ygaV-ygaP	0.109	273
insA9	0.109	274
insH-5	0.109	275
stfR-tfaR	0.109	275
lpxM	0.109	277
mipA	0.108	278
yeaG-yeaH	0.108	279
msrA	0.108	280
tamA-tamB-ytfP,tamA	0.108	281
ygiT	0.108	282
ybiJ	0.108	283
ygaQ	0.108	284
ileY	0.108	285
yhiS	0.107	286
spy	0.107	287
abrB	0.106	288
ypjA	0.106	289
csiD-lhgO-gabD-gabT-gabP	0.106	290
yodE	0.105	291
ryeG	0.105	292
entD-fepA,fepA	0.105	293
fes-entF-fepE-ybdZ,fes-ybdZ	0.105	293
astE-astB-astD-astA-astC	0.105	295
xthA	0.105	296
kefB-kefG-yheV,kefG	0.104	297
yheS-yheT-yheU-prkB,yheS-yheT-yheU	0.104	298
trpS-gph-rpe-dam-damX-aroB-aroK,dam-damX-aroB-aroK,damX-aroB-aroK	0.104	299
ansB	0.103	300
ypfM	0.102	301
yffB-dapE-ypfN	0.102	301
paoD-paoC-paoB-paoA	0.102	303
yagU	0.102	304
yhjA	0.101	305
treF	0.101	306
ypjB	0.101	307
ycgX	0.100	308
slyA	0.100	309
ydhI-ydhJ-ydhK,ydhI-ydhJ	0.100	310
yfdE	0.100	311