Top Promoters Bound by dicC

On this page you can access the list of promoter regions bound by dicC. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs) Scores Ranks
dicA 1.000 1
intK-ydfX-dicC 1.000 2
csrA,argZ-argY-argV-serV-csrA 0.656 3
ldtA 0.651 4
ydfA-ydfB-ydfC 0.643 5
yrhA 0.593 6
metH 0.575 7
iclR 0.575 8
yddJ-yddK-yddL 0.551 9
hybG-hybF-hybE-hybD-hybC 0.548 10
adhE 0.507 11
ychT 0.507 12
ychE 0.507 12
oppA5p 0.507 14
rclC-rclB-rclA 0.496 15
ykgD 0.496 15
ycgH 0.465 17
topB-selD 0.460 18
yidJ-yidK 0.449 19
yidL 0.449 20
bluF 0.441 21
ycgZ-ymgA-ariR-ymgC,ycgZ 0.441 22
ymgA-ariR 0.441 23
yeeX 0.439 24
rlmM 0.436 25
ypjC 0.429 26
ydfK-ynfT 0.426 27
cysC-cysN-cysD,ftsB-ygbE-cysC-cysN-cysD 0.421 28
iap 0.421 28
tpx 0.415 30
ycjG 0.415 31
cysH-cysI-cysJ 0.413 32
queD,queD-ygcN-ygcO 0.413 32
yahN 0.411 34
yahO 0.411 34
yfjL,yfjK-yfjL 0.410 36
lit 0.401 37
ymfD-ymfE 0.401 38
gcvP 0.384 39
elaD 0.382 40
yibS 0.369 41
pabB-nudL 0.368 42
gltS 0.366 43
yaiX 0.357 44
phoU-pstB-pstA-pstC 0.353 45
aspT 0.352 46
tatE 0.348 47
ynaE 0.348 48
ynaM 0.348 49
trpT 0.348 50
gltK-gltJ-gltI-insH-3,gltJ-gltI-insH-3,insH-3 0.345 51
rarD-yigI,yigF-yigG-rarD-yigI,yigI 0.338 52
pldA,pldA-recQ 0.338 53
ycgV 0.330 54
nhaR 0.329 55
trpS-gph-rpe-dam-damX-aroB-aroK,dam-damX-aroB-aroK,damX-aroB-aroK 0.325 56
xylE 0.324 57
insH-11 0.321 58
apaH-apaG-rsmA 0.318 59
sfmH-sfmF 0.317 60
envC-yibQ 0.316 61
yibG 0.314 62
lldP-lldR-lldD 0.309 63
sieB 0.307 64
kilR-ydaE 0.307 65
pflA 0.306 66
fhuE 0.306 67
hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ,hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ-ycfP 0.306 67
yqeC 0.302 69
ydeP 0.302 70
pitB 0.302 71
hemB 0.299 72
msyB-mdtG-lpxL,lpxL 0.298 73
yceA 0.298 73
rplF-rpsH-rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP 0.298 75
rplX-rplN-rpsQ-rpmC 0.298 76
ylcI 0.293 77
nohD 0.293 77
eno-pyrG 0.286 79
tldD 0.282 80
lnt-ybeX,ybeX 0.278 81
uspE 0.278 82
entS 0.277 83
fepC-fepG-fepD,fepG-fepD 0.277 84
uidC-uidB-uidA 0.277 85
ydfJ 0.277 86
dinI-pyrC,pyrC 0.276 87
lrhA 0.274 88
alaA-yfbR,alaA 0.274 89
bamA,bamA-skp,bamA-skp-lpxD-fabZ-lpxA-lpxB-rnhB-dnaE 0.272 90
ytfI 0.270 91
pliG 0.270 92
ycgL 0.270 92
ycgM,ycgM-ycgN 0.270 94
frc 0.270 95
ydaG-ydaF 0.270 96
ydiZ 0.269 97
ydcS-ydcT-ydcU-ydcV-patD 0.268 98
prfC 0.267 99
yrhB 0.264 100
sibA 0.262 101
yegK-yegL 0.262 102
tfaQ-stfQ-nohQ 0.262 103
ydfO-ynfO 0.262 103
tqsA 0.257 105
mdtI-mdtJ 0.257 106
yciE 0.254 107
pgk-epd,fbaA-pgk-epd 0.253 108
yadN 0.253 109
cycA 0.250 110
ttdA-ttdB-ttdT 0.247 111
ygeX 0.244 112
ydiN-ydiB-aroD 0.244 113
fnrS 0.244 114
ynaL 0.244 115
inaA-glpQ-glpT,glpQ-glpT 0.244 116
glpA-glpB,glpA-glpB-glpC 0.244 117
dauA 0.244 118
cca 0.243 119
prlF-yhaV 0.241 120
ybcL-ybcM 0.241 121
yfdV 0.238 122
ygeH 0.238 123
cpxA-cpxR 0.237 125
cpxP 0.237 125
cpxQ 0.237 125
rpsU-dnaG-rpoD,rpsU,rpsU-dnaG 0.237 127
tsaD 0.237 128
yjiC 0.236 129
iraD-ytiD-idlP 0.236 129
ytiC 0.236 131
iraD-idlP 0.236 131
yeaL 0.235 133
yoaI 0.235 134
proY 0.235 135
rne 0.233 136
rluC 0.233 137
nc6 0.233 138
rluB 0.232 139
alaX-alaW 0.232 140
yfeC-yfeD 0.232 140
yfeA 0.232 142
htrE-yadV 0.232 143
rpsC-rplV-rpsS-rplB-rplW-rplD-rplC,rplV-rpsS-rplB-rplW-rplD-rplC 0.230 144
rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV-rpsS-rplB-rplW-rplD-rplC-rpsJ,rpsC-rplV-rpsS-rplB-rplW-rplD-rplC-rpsJ,rplB-rplW-rplD-rplC-rpsJ,rplV-rpsS-rplB-rplW-rplD-rplC-rpsJ 0.230 145
ypaB 0.229 146
nrdA-nrdB-yfaE 0.229 147
yjbI 0.229 148
ymdA-ymdB-clsC,ymdA-ymdB,ymdA 0.228 149
yfhG-glrK-glmY,glmY 0.227 150
ytfB 0.227 151
fklB,fklB-cycA 0.227 151
ygfI-yggE-argO,argO 0.227 153
yajR 0.226 154
apaH-apaG-rsmA-pdxA-surA,surA,rsmA-pdxA-surA 0.225 155
envZ-ompR,ompR 0.224 156
greB-yhgF,greB 0.224 156
ynjH 0.224 158
gdhA 0.224 158
ileU 0.223 160
rrlA-rrfA,rrlA 0.223 160
ileV-alaV,ileV 0.223 163
rrfD-rrlD 0.223 163
ileT-alaT 0.223 163
rrlH-rrfH 0.223 165
rng 0.223 166
dusA-pspG,dusA 0.223 167
yiiM 0.223 168
ydcN,ydcN-ydcP 0.223 169
yfjV 0.223 170
yraI-yraJ-yraK 0.219 171
yihN 0.219 172
yhjX 0.218 173
yagL-yagM 0.218 174
ygeK-ygeL 0.217 175
dicF 0.217 176
gadC 0.217 177
yhbX 0.213 178
trkG 0.213 179
rzoD 0.213 180
rzoR 0.213 180
minE-minD-minC 0.213 182
cutA-dcuA-aspA,dcuA-aspA,aspA 0.212 183
fxsA 0.212 183
yjfZ 0.212 185
ytfA 0.212 185
ykgL 0.212 187
opgB 0.211 188
ybfH 0.210 189
dsrB 0.210 190
yodD 0.210 190
yedP 0.210 192
insH-7 0.209 193
pyrG-mazG-mazF-mazE,mazG-mazF-mazE 0.208 194
eaeH-insE-1-insF-1-insEF1 0.208 195
ybfQ 0.207 196
yebF-yebG,yebG 0.207 197
purT 0.207 197
yjiA 0.207 199
yjiA-yjiX 0.207 200
uspC 0.206 201
insB-5-insA-5-insAB5 0.206 202
thrL,thrL-thrA-thrB-thrC,thrL-thrA-thrB 0.205 203
cadC 0.204 204
ygfK-ssnA 0.204 205
degP 0.204 206
shoB 0.203 207
ykgR 0.203 208
acrE-acrF 0.202 209
ppiC 0.202 210
fdoH 0.201 211
yeeL 0.200 212
shiA-amn,shiA 0.200 212
yneO 0.200 214
mtr-deaD,deaD 0.199 215
deaD-yrbN,yrbN 0.199 215
tyrB 0.199 217
yidZ 0.198 218
yldA 0.197 219
ftsQ-ftsA,ftsQ-ftsA-ftsZ,ftsQ 0.197 220
alsE-alsC-alsA-alsB 0.196 221
gtrA-gtrB-gtrS 0.196 222
ybaL 0.195 223
ulaD-ulaE 0.195 224
nudC-hemE-nfi,nudC-hemE-nfi-yjaG-hupA 0.195 225
thiF-thiE-thiC-rsd-thiS,rsd 0.195 226
yfcD-yfcE,yfcE 0.193 227
yjjA-dnaC-dnaT,dnaC-dnaT 0.193 228
pheL-pheA 0.192 229
dsdA 0.192 230
yceQ 0.191 231
ybjX 0.190 232
macA-macB 0.190 233
ygbN 0.187 234
yhiY 0.187 235
pgaD-pgaC-pgaB-pgaA 0.186 236
ycdT 0.186 237
yafZ-ykfA,ykfA 0.184 238
yjeH 0.183 239
groS-groL,groS-groL-yjeI 0.183 239
lptA-lptB,lptA-lptB-rpoN,lptA-lptB-rpoN-hpf 0.183 241
eutA-eutH 0.183 242
ybgE-cydX 0.183 243
fimA3p 0.182 244
fimB 0.182 245
fliY-fliZ-fliA 0.181 246
cdsA 0.181 247
ynfL 0.181 248
ynfM 0.181 249
ycgX 0.181 250
yhaJ 0.180 251
yhaK-yhaL 0.180 251
ynaK-ydaY 0.180 253
yqfA 0.179 254
bglA 0.179 255
ibpB 0.179 256
ppk,ppk-ppx 0.179 257
ftnB 0.177 258
yehE-mrp,mrp 0.176 259
metG 0.176 260
mukF-mukE 0.176 261
lsrR,lsrK-lsrR 0.176 262
lsrA-lsrC-lsrD-lsrB-lsrF-lsrG-tam 0.176 262
insE-5-insF-5-insEF5 0.176 264
rem 0.175 265
hha-tomB 0.175 266
yoaH 0.174 267
naRNA2 0.171 268
naRNA1 0.171 268
crfC-yjcZ 0.171 270
yjdM 0.171 271
proC 0.170 272
yaiI-aroL-yaiA-aroM-yaiE-ykiA,yaiI-aroL-yaiA,yaiI 0.170 272
argH 0.169 274
dtpC 0.168 275
ydeR-ydeS-ydeT 0.168 276
rseP 0.168 277
yfeN 0.168 278
xapB-xapA 0.168 279
skp-lpxD,skp-lpxD-fabZ-lpxA,skp-lpxD-fabZ-lpxA-lpxB 0.167 280
rcsA 0.167 281
glnX-glnV-metU-glnW 0.166 282
glnX-glnV-metU-glnW-glnU-leuW-metT 0.166 283
sibE 0.166 284
sibD 0.166 285
ibsE 0.166 285
yeaX 0.163 287
panC 0.162 288
wbbL 0.162 289
sodC-ydhF,ydhF 0.161 291
ydhL 0.161 291
ydhM-nemA-gloA,ydhM,ydhM-nemA-gloA-rnt,ydhM-nemA 0.161 291
torZ-torY 0.161 293
sspB-sspA 0.161 294
hchA 0.160 295
rhsO-ybfC 0.160 296
acrD 0.158 297
ycbL 0.158 298
yjcC 0.157 299
yjcB 0.157 300
bacA 0.156 301
pgk,fbaA-pgk,mscS-fbaA-pgk 0.156 302
yicL 0.155 303
yejG 0.152 304
yeiQ 0.152 305
nlpC-btuD-btuE,btuE 0.152 306
proV-proW-proX 0.152 307
ytjA 0.152 308
yjjU-yjjV 0.152 309
tynA 0.152 310
ribB 0.150 311
yqiC,yqiC-ygiL 0.150 312
pbpG 0.150 313
yjgH 0.150 314
glgP-glgA-glgC-glgX-glgB,glgB 0.150 316
yhgO 0.150 316
yhgP 0.150 316
alkB-ada 0.150 318
idnK 0.149 319
ilvL-ilvM-ilvE-ilvD-ilvA-ilvG-ilvX,ilvL,ilvL-ilvM-ilvE-ilvG-ilvX 0.148 320
yifB 0.148 321
yceB 0.148 322
uspE-fnr,fnr 0.147 323
yhdU 0.147 324
sdiA-yecC-yecS-dcyD-fliY,yecC-yecS-dcyD-fliY,fliY 0.147 325
lipB-ybeD,ybeD 0.147 326
sslE 0.146 327
minE-minD 0.145 328
miaA-hfq-hflX,miaA-hfq-hflX-hflK-hflC 0.145 329
crr 0.144 330
mntP 0.143 331
ybgU 0.143 332
sdhC-sdhD-sdhA-sdhB,sdhC-sdhD-sdhA-sdhB-sucA-sucB-sucC-sucD-sdhX 0.143 333
gltA 0.143 334
ybgV 0.143 334
ribC 0.142 336
mdtK 0.142 336
icdC 0.142 338
glpD 0.141 339
glpR-glpG-glpE 0.141 340
hybG-hybF-hybE-hybD 0.141 341
ahr 0.140 342
intB 0.140 342
yajO 0.140 344
ykgE-ykgF-ykgG 0.139 345
eutM-eutD-eutT-eutQ-eutP-eutS 0.139 346
glnG-glnL-glnA-yshB,glnG-glnL-glnA,glnL-glnA,glnA 0.139 347
typA 0.139 347
queE 0.138 349
ygcG 0.138 349
yqcG 0.138 351
cyaA 0.138 352
hemY-hemX-hemD-hemC,hemD-hemC,hemX-hemD-hemC 0.138 353
yadI 0.138 354
mdh 0.138 355
argR 0.138 356
gadW 0.137 357
gadY 0.137 358
ydgC 0.137 359
rstA-rstB,rstA-rstB-tus 0.137 360
yhhI 0.137 361
dps 0.137 362
yeaK-yeaL,yeaK 0.137 363
yobB-exoX 0.136 364
kdsA,kdsA-rdlA 0.136 365
viaA-ravA 0.136 366
kup 0.136 366
yahI-yahJ 0.136 368
yahH 0.136 369
insC-6-insD-6-insCD6 0.136 370
sfmC-sfmD 0.135 371
ytfL5p 0.135 372
chaC 0.135 373
setC 0.134 374
ylcH 0.133 375
ybcN-ninE-ybcO-rusA-ylcG 0.133 376
ynaI 0.133 377
insH-4,insH-4-ynaJ 0.133 378
yciT 0.132 379
ymiD 0.132 379
uhpT 0.132 381
ybiJ-ybiI-ybiX-ybiL,ybiI-ybiX-ybiL,ybiL 0.132 382
yhjC,yhjC-yhjD 0.132 383
rpsH-rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV,rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV,rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC-rplV 0.131 384
rpsN-rplE-rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC,rplX-rplN-rpsQ-rpmC-rplP-rpsC 0.131 385
pdxH-mliC-anmK,anmK,mliC-anmK 0.130 386
slyB 0.130 386
malQ-malP,malP 0.129 388
malT 0.129 389
yedY-yedZ 0.129 390
yedV-yedW,yedW 0.129 391
hiuH,hiuH-yedY-yedZ,hiuH-yedY-yedZ-zinT 0.129 391
glcC 0.129 393
hcr 0.129 394
wzxB-rfbC-rfbA 0.129 395
nfuA 0.129 396
dnaJ-insL-1 0.128 397
sra-bdm 0.128 398
osmC 0.128 398
sra 0.128 400
agaR 0.128 401
kbaZ-agaV-agaW-agaA 0.128 401
tktB 0.128 403
ykfI-yafW-ykfG-ykfH 0.128 404
opgG-opgH 0.127 405
opgC 0.127 406
yfbN 0.127 407
yfbP 0.127 408
dgcZ 0.127 409
ypjB 0.126 410
iraM 0.126 411
ymgK 0.126 412
purL 0.126 413
mltF 0.126 413
ydcO 0.126 415
yciE-yciF-yciG,yciG 0.126 416
zntR-yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM 0.126 417
rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM-rpmJ 0.126 418
exoD 0.125 419
renD 0.125 419
insE-3-insF-3-emrE 0.125 421
insE-3-insF-3-insEF3 0.125 421
ytfF-qorB,qorB 0.125 423
ytfH 0.125 424
lipB 0.124 425
rtn 0.124 426
dbpA 0.123 427
ettA 0.123 428
slt,slt-trpR 0.123 429
pal-ybgF-lysT-valT,pal-ybgF-lysT-valT-lysW-valZ-lysY-lysZ,pal-ybgF-lysT-valT-lysW-valZ-lysY,pal-ybgF-lysT-valT-lysW-valZ-lysY-lysZ-lysQ,pal-ybgF-lysT-valT-lysW-valZ 0.122 430
yciY 0.122 431
aaeB-aaeA-aaeX 0.122 432
rcsD-rcsB 0.122 433
yegI 0.121 434
yegJ 0.121 435
ampD-ampE 0.120 436
nadC 0.120 437
yegH 0.120 438
ydgK-rsxA-rsxB-rsxC-rsxD-rsxG-rsxE-nth,ydgK-rsxA-rsxB 0.120 439
yhcN 0.120 440
rhoL-rho,rhoL-rho-wecA,rhoL-rho-wecA-wzzE,rhoL 0.119 441
yjaH 0.119 442
dacD,sbmC-dacD 0.119 443
sbcB 0.119 444
ubiG 0.119 445
gyrA 0.119 446
yqgG 0.119 447
metK 0.119 447
yqgD 0.119 449
yccT 0.118 450
yccU 0.118 451
chaA 0.118 452
chaB-chaC 0.118 453
yzcX 0.118 454
acpP-fabF-pabC,acpP,acpP-fabF-pabC-yceG,acpP-fabF 0.118 455
racR 0.118 456
ydaS-ydaT-ydaU-ydaV-ydaW-rzpR 0.118 456
yqcE-ygcE 0.117 458
ygcW 0.117 459
IS129 0.117 461
pbpC-yfhM 0.117 461
sseA 0.117 461
aes 0.117 463
gsk 0.117 463
pdxY-tyrS-pdxH,tyrS-pdxH 0.117 465
mliC 0.117 466
osmB 0.116 467
yagK 0.116 468
aspC-ompF,ompF 0.115 469
pabC-yceG-tmk,pabC-yceG-tmk-holB-ycfH 0.115 470
fabH-fabD-fabG,fabH-fabD-fabG-acpP 0.115 471
fhuA,fhuA-fhuC,fhuA-fhuC-fhuD,fhuA-fhuC-fhuD-fhuB 0.114 472
ybgS 0.113 473
aroG 0.113 473
wcaM-wcaL-wcaK 0.113 475
ibpA,ibpB-ibpA 0.113 476
yidQ 0.113 476
speB 0.113 478
fadA-fadB 0.112 479
pepQ-yigZ,pepQ-yigZ-trkH,pepQ-yigZ-trkH-hemG 0.112 480
ybhM 0.112 481
ycgJ 0.112 482
adeP 0.112 483
yieH 0.112 484
sbp 0.112 485
gpmA 0.111 486
yhhH 0.111 487
sufD-sufC-sufB-sufA,sufE-sufS-sufD-sufC-sufB-sufA 0.111 488
rarD 0.111 489
rpsK-rpsM-rpmJ-secY-rplO-rpmD-rpsE-rplR 0.111 490
yaiT 0.110 491
pncC,recX-recA-pncC,recA-pncC 0.109 492
aidB 0.109 493
glrK 0.109 494
rrfF-thrV-rrfD-rrlD-alaU-ileU-rrsD,alaU-ileU-rrsD,rrsD 0.109 495
yrdA 0.109 496
mpaA-ymjC 0.108 497
mpaA 0.108 498
bamB-yfgM,yfgM 0.108 499
pqqL 0.108 500
yddB-yddA,yddA 0.108 501
yneP 0.108 502
mutM 0.108 503
prpR 0.107 504
flgK-flgL 0.107 505
emrE 0.107 506
ylcJ 0.107 507
frsA,frsA-crl 0.106 508
trkA 0.105 509
yoeA 0.105 510
yeaC-msrB,msrB 0.105 511
gapA,gapA-yeaD 0.105 511
tufA 0.105 513
ubiI-ubiH-pepP-ygfB,ubiH-pepP-ygfB 0.104 514
ssrS-fau,ssrS,ssrS-fau-sibC 0.104 515
ybeF 0.104 516
intE-xisE-ymfH 0.104 517
cadA 0.104 518
ileS-lspA,ileS-lspA-fkpB-ispH,ileS,ileS-lspA-fkpB 0.104 519
ygdI 0.104 520
csdA-csdE 0.104 521
ymfI 0.103 522
pepE 0.103 523
aaeR 0.103 524
rnpB-garK-garR-garL-garP 0.103 525
garD 0.103 526
chiA 0.102 527
yneL 0.102 528
exoX 0.102 529
gss 0.102 530
pheM-rplT,rplT 0.102 531
rplT-rpmI 0.102 531
ydjO 0.101 533
mokC-hokC 0.101 534
nhaA-nhaR,nhaA 0.101 535
ohsC 0.101 536
ydjE 0.101 537
fucR 0.101 538
gnd 0.101 539
gndA 0.101 540
gntX-nfuA 0.100 541
bioH 0.100 542
yjeI 0.100 543