Top Promoters Bound by iclR

On this page you can access the list of promoter regions bound by iclR. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs)	Scores	Ranks

ykfC	1.000	1
metH	0.888	2
iclR	0.888	3
yciS-yciM,yciS-yciM-pyrF-yciH	0.753	4
ykiE	0.637	5
insA-7	0.637	5
fecA-fecR-fecI,fecR-fecI	0.637	7
waaH-tdh-kbl,tdh-kbl	0.604	8
aceB-aceA-aceK,aceB-aceA	0.578	9
agaR	0.569	10
kbaZ-agaV-agaW-agaA	0.569	11
yjeJ	0.544	12
araC,araC-yabI	0.536	13
araD-araA-araB,araA-araB	0.536	14
yiiF	0.482	15
ybiJ-ybiI-ybiX-ybiL,ybiI-ybiX-ybiL,ybiL	0.465	16
uvrB	0.461	17
ansB	0.457	18
yhhZ-insA-6-insB-6-insAB6	0.457	19
recB	0.445	20
ycaC	0.438	21
ycaD	0.438	21
glnE-ygiF	0.434	23
ygiM,ygiM-cca	0.434	23
yfaP-yfaQ-yfaT-yfaA-yfaS	0.432	25
gpp	0.417	26
micL	0.388	27
rybB	0.387	28
grpE	0.386	29
nadK-recN,nadK	0.386	30
speD	0.378	31
ileY	0.377	32
ygaQ	0.377	33
nac	0.373	34
asnV	0.373	35
serT	0.369	36
hyaA-hyaB-hyaC-hyaD-hyaE-hyaF	0.369	36
cirA	0.364	38
ygdT	0.351	39
mutH	0.351	39
galS	0.345	41
yifB	0.344	42
ilvL-ilvM-ilvE-ilvD-ilvA-ilvG-ilvX,ilvL,ilvL-ilvM-ilvE-ilvG-ilvX	0.344	42
cadC	0.343	44
mcbA	0.340	45
rlmF	0.340	45
opgC	0.338	47
opgG-opgH	0.338	47
yceI-yceJ	0.331	49
yfgH-yfgI	0.329	50
ybdM	0.328	51
gltB-gltD-gltF	0.325	52
yhcC	0.325	53
yicL	0.322	54
ynaJ	0.320	55
sfmC-sfmD	0.318	56
ybhK	0.313	57
moaA-moaB-moaC-moaD-moaE	0.313	58
glk	0.313	59
yfeO	0.313	60
serA,serA-ibsC	0.308	61
trpA-trpB-trpC-trpD-trpE-trpL,trpD-trpE-trpL,trpL	0.306	62
yciV-yciO,yciV-yciO-yciQ	0.306	63
yljB	0.297	64
cspD	0.297	65
clpS,clpS-clpA	0.297	65
ydeA	0.296	67
ymgF	0.295	68
yeiQ	0.295	69
yeeJ	0.294	70
ycgH	0.286	71
mnmG-mioC-asnC,mioC-asnC,asnC	0.286	72
asnA	0.286	72
pyrD	0.286	74
gntP	0.285	75
uxuA-uxuB	0.285	75
ansP	0.285	77
yncG	0.285	78
proC	0.285	79
yaiI-aroL-yaiA-aroM-yaiE-ykiA,yaiI-aroL-yaiA,yaiI	0.285	80
aroB	0.285	81
yihD,yihD-srkA-dsbA,yihD-srkA	0.283	82
malI	0.283	83
malX-malY	0.283	84
ileS-lspA,ileS-lspA-fkpB-ispH,ileS,ileS-lspA-fkpB	0.283	85
shoB	0.282	86
ohsC	0.282	86
ompL	0.281	88
yhhY	0.281	89
ryhB	0.281	90
yhhW-yhhX,yhhX	0.281	91
ldtE	0.279	92
pheU	0.275	93
cutC	0.274	94
sra	0.273	95
osmC	0.273	96
sra-bdm	0.273	97
cvrA-ldcA,ldcA	0.272	98
idi	0.270	99
yqfG	0.270	100
arpB	0.268	101
ihfA-pheT-pheS-pheM-rplT-rpmI-infC-thrS,pheM-rplT-rpmI-infC-thrS,rplT-rpmI-infC-thrS,thrS,infC-thrS	0.268	102
lipA	0.268	103
insJ	0.267	104
insJK	0.267	104
insK	0.267	106
hokA	0.267	107
ynfK	0.267	108
uhpC-uhpB-uhpA-ilvN-ilvB-ivbL,uhpA-ilvN-ilvB-ivbL,ivbL,ilvN-ilvB-ivbL	0.263	109
rpiB,rpiB-yjdP	0.261	110
alsE-alsC-alsA-alsB-rpiR,alsA-alsB-rpiR,alsB-rpiR,rpiR	0.261	111
rpsF-priB-rpsR-rplI	0.261	112
yjfY	0.261	113
nmpC	0.259	114
essD-rrrD-rzpD	0.259	114
asmA-dcd-udk,dcd-udk	0.257	116
yegE	0.257	116
hiuH,hiuH-yedY-yedZ,hiuH-yedY-yedZ-zinT	0.256	118
livF-livG-livM-livH-livK,livG-livM-livH-livK,livM-livH-livK	0.253	119
panM	0.253	120
umpH	0.249	121
lpxD	0.249	122
apaH-apaG	0.248	123
yfeA	0.247	124
yddM	0.247	125
pck	0.247	126
yhgE	0.247	127
fecE-fecD-fecC-fecB-fecA,fecC-fecB-fecA,fecB-fecA	0.244	128
astE-astB-astD-astA-astC	0.243	129
xthA	0.243	129
rem	0.242	131
yadC-yadK-yadL-yadM	0.239	132
metA	0.239	133
yjaB	0.239	134
ydiV	0.237	135
mrcA	0.236	136
hofP-hofO-hofN-hofM	0.236	137
cyoD-cyoC-cyoB-cyoA,cyoE-cyoD-cyoC-cyoB-cyoA	0.236	138
tpiA	0.235	139
yiiR	0.235	140
lit	0.234	141
etk-etp-gfcE	0.232	142
yhdV	0.230	143
rhsD-ybbC-rhsH-ybbD	0.230	144
ybiX	0.229	145
ybhN-clsB-ybhP	0.229	146
ybhQ	0.229	147
pheV	0.227	148
serC-aroA-ycaL,serC,serC-aroA	0.225	149
ydcH	0.225	150
grcA	0.224	151
ung	0.224	151
yqiM	0.223	153
yqjA-mzrA,yqjA-mzrA-yqjC-yqjD	0.223	153
aroP	0.222	155
pdhR,pdhR-aceE-aceF-lpd	0.222	155
ubiX	0.221	157
yfdV	0.221	158
yphB-yphC	0.220	159
yjhF	0.219	160
yfgO	0.218	161
bepA-yfgD	0.218	162
yfcI	0.217	163
gshB-yqgE-yqgF	0.217	164
yhjC,yhjC-yhjD	0.216	165
trxB	0.215	166
lrp	0.215	167
gltA	0.215	168
yqjI	0.215	169
mug-yqjH,yqjH	0.215	170
bglX	0.215	171
dld	0.215	171
crp,crp-yhfK	0.215	173
yhfA	0.215	174
fucP-fucI-fucK-fucU-fucR	0.212	175
mdtI-mdtJ	0.210	176
ydgV	0.210	177
tqsA	0.210	177
yciA-yciB-yciC,yciB-yciC	0.209	179
ompW	0.209	179
yoeA	0.209	181
yafT	0.209	182
phoU-pstB	0.208	183
dctA	0.207	184
ogt-abgT-abgB-abgA	0.207	185
abgR	0.207	185
tpr-tyrV-tyrT-purU-ychJ-rttR,tyrV-tyrT-purU-ychJ,ychJ	0.207	187
nanS	0.206	188
psd-rsgA,rsgA	0.204	189
orn-glyV-glyX-glyY,orn	0.204	189
yfjV	0.204	191
ygbF-ygbT-casE-casD	0.204	192
insA9	0.204	193
insB9	0.204	194
ompN	0.204	195
micC	0.204	195
ygaC	0.203	197
ygaM	0.203	197
yncC	0.202	199
yjbQ-yjbR	0.202	200
tnaC,tnaC-tnaA	0.202	201
fabI,yciW-fabI	0.202	202
nc7	0.202	203
galP	0.202	204
zapC	0.202	205
ydhQ	0.201	206
valV-valW	0.201	206
ydhR	0.201	208
pflD-pflC	0.200	209
treC	0.198	210
mgtA5p	0.198	210
eptB	0.197	212
ygjV	0.197	213
yhdT-panF-prmA-dusB,yhdT-panF-prmA	0.197	214
hybG-hybF-hybE-hybD-hybC	0.195	215
yhiD	0.195	216
rhtB	0.192	217
pldB-yigL	0.192	217
yqjE-yqjK	0.191	219
yjhG-yjhH-yjhI	0.191	220
insE-5-insF-5-insEF5	0.191	221
allS	0.191	222
allA	0.191	222
yfgJ	0.190	224
yceH	0.190	225
umpH-nagC-nagA-nagB,nagC-nagA-nagB	0.190	226
nagE	0.190	226
yhcE	0.189	228
degQ,degQ-degS	0.189	229
ygeA	0.189	230
nudE	0.187	231
yrfF	0.187	232
ugd	0.187	233
norR	0.186	234
norV-norW	0.186	235
mpaA	0.186	236
mpaA-ymjC	0.186	237
alpA	0.184	238
lrhA	0.184	239
yaiP	0.183	240
aslA	0.183	241
glmZ	0.183	241
rtn	0.182	243
yehA-yehB-yehC-yehD	0.181	244
rbsB-rbsK-rbsR	0.179	245
yecT	0.178	246
yecV	0.178	247
bcsQ	0.177	248
bcsQ-yhjR,yhjR	0.177	249
bcsE-bcsF,bcsE-bcsF-bcsG	0.177	249
ygfF	0.177	251
fabH-fabD-fabG,fabH-fabD-fabG-acpP	0.177	252
cedA	0.176	253
katE	0.176	254
ydjO	0.176	255
sdaC-sdaB,sdaC,sdaC-sdaB-ygdG	0.176	256
intF	0.176	257
yahV	0.176	258
ubiG	0.176	259
tyrA-aroF	0.175	260
yfiL	0.175	260
yraI-yraJ-yraK	0.175	262
flk	0.174	263
gcl-hyi-glxR-ybbW-allB-ybbY-glxK	0.173	264
ygiL	0.172	265
insH-11	0.170	266
slp-dctR	0.170	267
yafC	0.170	268
yafD,yafD-yafE	0.170	268
hscA,iscX-fdx-hscA	0.168	270
feoA-feoB-feoC	0.167	271
yjjM,lgoT-yjjM	0.167	272
lgoD	0.167	272
pfkA	0.167	274
yadN	0.166	275
yfcL-epmC-yfcA-mepA-aroC,epmC-yfcA-mepA-aroC	0.166	276
fsr	0.165	277
ushA	0.165	277
obgE-yhbE	0.165	279
hisL-hisG-hisD-hisC-hisB-hisH-hisA-hisF-hisI,hisL	0.164	280
yeeY-yeeZ-yefM-yoeB,yeeZ-yefM-yoeB,yefM-yoeB	0.164	281
sspA-rpsI-rplM,rpsI-rplM	0.163	282
leuU	0.162	283
leuU-secG,secG	0.162	283
hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ,hinT-ycfL-lpoB-thiK-nagZ-ycfP	0.162	285
fhuE	0.162	286
yjhZ	0.162	287
yjhR	0.162	287
yqeF	0.161	289
yqeG	0.161	289
ydcC	0.161	291
omrA	0.161	292
lplT-aas	0.161	293
ndh	0.161	294
yecN-cmoA-cmoB	0.161	295
cmoA-cmoB	0.161	296
rplS-trmD-rimM	0.161	297
ribE-nusB-thiL,ribE-nusB-thiL-pgpA	0.161	298
ymgC	0.160	299
vsr-dcm	0.159	300
codB-codA	0.158	301
fepC-fepG-fepD,fepG-fepD	0.158	302
entS	0.158	302
nuoN-nuoM-nuoL-nuoK-nuoJ-nuoI-nuoH-nuoG-nuoF-nuoE-nuoC-nuoB-nuoA,nuoE-nuoC-nuoB-nuoA,nuoC-nuoB-nuoA,nuoB-nuoA	0.158	304
rrlA-rrfA,rrlA	0.158	305
rrlB-rrfB,rrlB	0.158	305
feaR	0.157	307
feaB	0.157	307
wcaB-wcaA-wzc-wzb-wza	0.157	309
rzoQ	0.157	310
cheZ-cheY-cheB-cheR-tap-tar	0.157	311
iscA-iscU-iscS-iscR-trmJ,trmJ,iscR-trmJ	0.156	312
suhB	0.156	313
bfr-bfd	0.156	314
clpB	0.155	315
ryfD	0.155	315
yfdK-yfdL-yfdM-yfdN-oweS	0.154	317
yfdP-yfdQ	0.154	317
pflB-focA,focA	0.153	319
zwf	0.153	320
yebK-pykA,yebK	0.153	320
yfhR	0.153	322
flgN-flgM-flgA	0.153	323
flgB-flgC-flgD-flgE-flgF,flgB-flgC-flgD-flgE-flgF-flgG-flgH-flgI-flgJ	0.153	324
fhuF	0.152	325
yjjZ	0.152	325
ymdG	0.152	327
putA	0.152	328
putP	0.152	329
nrdA-nrdB-yfaE	0.151	330
ypaB	0.151	331
yccE	0.151	332
cbpM-cbpA	0.151	333
fdhF	0.150	334
ygaY	0.150	335
bamA,bamA-skp,bamA-skp-lpxD-fabZ-lpxA-lpxB-rnhB-dnaE	0.150	336
mntH	0.148	337
nupC,nupC-insL-3	0.148	337
fumC	0.148	339
nc9	0.148	340
yfeR	0.147	341
yfeH	0.147	342
chiA	0.146	343
ynfN	0.146	344
ynfQ	0.146	344
ynfR	0.146	346
rrsC,rrsC-gltU,rrsC-gltU-rrlC-rrfC	0.146	347
rrfF-thrV-rrfD-rrlD-alaU-ileU-rrsD,alaU-ileU-rrsD,rrsD	0.146	348
glcA-glcB	0.146	349
glcB-glcG	0.146	350
ybiC	0.145	351
hslO	0.144	352
truC-yqcC-csrB	0.144	353
fliY-fliZ-fliA	0.144	354
ynaI	0.143	355
insH-4,insH-4-ynaJ	0.143	356
ybcN-ninE-ybcO-rusA-ylcG	0.142	357
ylcH	0.142	358
yhfL	0.142	359
frlA-frlB-frlD-yhfR-frlC	0.142	360
iscX-fdx-hscA-hscB	0.142	361
hscA-hscB-iscA	0.142	362
yeeO	0.142	363
yibT	0.140	364
yibL	0.140	364
raiA,raiA-pheL	0.140	366
pheL-pheA	0.140	367
ydaG-ydaF	0.140	368
yedY-yedZ	0.140	369
yjiK	0.139	370
rutR	0.139	371
rutG-rutF-rutE-rutD-rutC-rutB-rutA	0.139	372
appY	0.139	373
rpsI3p	0.139	374
kduI	0.139	375
dcuD	0.138	376
nanR	0.138	377
deoB-deoD	0.138	378
arcA	0.138	379
yjjY	0.138	380
rssB-galU,rssB	0.137	381
smf	0.137	382
fmt-rsmB	0.137	383
yqeA	0.137	384
nikR	0.137	385
omrB	0.137	386
galR	0.137	387
yneO	0.136	388
deoR-ybjG,ybjG	0.136	389
mdfA	0.136	389
ruvC-yebC	0.135	391
paaZ	0.135	392
paaA-paaB-paaC-paaD-paaE-paaF-paaG-paaH-paaI-paaJ-paaK	0.135	392
phoE	0.134	394
proB,proB-proA,proB-proA-thrW	0.134	394
rrfD-rrlD	0.133	396
cyaY	0.133	397
yzcX	0.133	398
yciU-clsA	0.132	399
yciY	0.132	400
topB-selD	0.131	401
sixA	0.131	402
ftsH-rlmE,rlmE	0.130	403
yhbY	0.130	404
ybhC	0.130	405
racR	0.129	406
pbl	0.129	407
yjeV	0.129	408
gnd	0.127	409
glxK	0.126	410
yedQ-yodC-yedI,yedI	0.126	411
yedA	0.126	411
ydfG,ydfG-ydfH	0.126	413
dcp	0.126	414
yjhQ-yjhX,yjhP-yjhQ-yjhX	0.125	415
secE-nusG,secE-nusG-rplK-rplA	0.125	416
sdiA	0.125	417
sdsN	0.125	418
sucA-sucB,sucA-sucB-sucC-sucD	0.125	419
trpR	0.123	420
pncC,recX-recA-pncC,recA-pncC	0.123	421
ydjF	0.123	422
lolA-rarA	0.123	423
ydhS	0.123	424
rhtC	0.123	425
yedS	0.123	426
yedJ-yedR	0.123	427
blc	0.122	428
yegI	0.121	429
yegJ	0.121	430
yncH	0.121	431
ddlA	0.121	432
yaaI	0.120	433
dnaK-dnaJ-insL-1,dnaK-dnaJ,dnaK	0.120	433
ydcJ	0.120	435
ydcI	0.120	436
ygfK-ssnA	0.120	437
galK	0.119	438
fruR,fruR-mraZ-rsmH-ftsL	0.119	439
spf	0.119	440
yrdB-aroE-tsaC-yrdD-smg,tsaC-yrdD-smg,smg	0.119	441
ybdN	0.119	442
yfjW	0.118	443
yieE,yieE-chrR	0.118	444
nc1	0.117	445
sspB-sspA	0.117	446
yceJ-yceO-solA,yceO-solA,solA	0.116	447
yciT	0.116	449
yciT-yciZ	0.116	449
ymiD	0.116	449
fabD-fabG-acpP	0.116	451
prpR	0.115	452
prpB-prpC-prpD-prpE	0.115	452
nanS-nanM-nanC,nanM-nanC,nanC	0.115	454
ycgG	0.115	455
cutA-dcuA-aspA,dcuA-aspA,aspA	0.114	456
fxsA	0.114	456
yadE	0.113	458
emtA	0.113	459
proV-proW-proX	0.113	460
nuoG	0.111	461
yfeK-yfeS	0.110	462
pdxK	0.110	463
phoQ	0.110	464
tfaX	0.108	465
insH21	0.107	466
ybaL	0.107	467
rnhA,gloB-rnhA	0.107	468
dnaQ-aspV,dnaQ	0.107	469
mdtE-mdtF	0.107	470
ygcB	0.106	471
sokX	0.106	472
rplJ-rplL-rpoB-rpoC,rplJ-rplL	0.106	473
yfdR-yfdS-yfdT	0.106	474
elyC	0.106	475
smtA-mukF-mukE-mukB,smtA-mukF-mukE	0.106	476
intE-xisE-ymfH	0.106	477
glyA	0.105	478
hmp	0.105	478
ygcW	0.105	480
yqcE-ygcE	0.105	480
gndA	0.105	482
trkA	0.105	483
ynaE	0.104	484
ynaM	0.104	485
ydfK-ynfT	0.104	486
ebgA-ebgC	0.104	487
ybfF,fldA-ybfE-ybfF	0.104	488
seqA-pgm-ybfP,seqA-pgm	0.104	488
yfgM-hisS-ispG,ispG-sroE	0.104	490
copA	0.103	491
glsA-ybaT	0.103	491
ybfP	0.103	493
ycaL	0.103	494
ypfM	0.103	495
yffB-dapE-ypfN	0.103	495
acrB-acrA,acrA	0.103	497
mscK	0.103	498
mcrC-mcrB	0.102	499
asr	0.102	500
ydgU	0.102	501
gadC	0.101	502
yadG-yadH-yadI,yadG-yadH	0.101	503
can	0.101	504
bdcA	0.101	505
yjgJ-tabA,yjgJ	0.101	506
yccT	0.100	507
yccU	0.100	508