Top Promoters Bound by uxuR

On this page you can access the list of promoter regions bound by uxuR. Promoter regions are named by the RegulonDB list of Transcription Units (TUs) that start with the same gene and defined as the 500bp upstream and 200bp downstream of the TU start position. TF promoter scores are scaled so that 1 is the top scoring promoter for a TF and 0 is a the average score across all promoters for the TF. Promoters are then ranked with 1 being the strongest scoring promoter. Only promoters with a TF hit scoring above 0.2 are shown.

Type in the header boxes to filter rows. Click headers to sort columns.

Promoter (TUs) Scores Ranks
uxuA-uxuB 1.000 1
gntP 1.000 2
yeaO 0.788 3
typA5p 0.637 4
rraA-menA,menA 0.565 5
cheZ-cheY-cheB-cheR-tap-tar 0.535 6
yddM 0.528 7
yegT-yegU-yegV 0.501 8
argD-pabA,pabA 0.435 9
bcr 0.427 10
yecC3p 0.416 11
eno 0.411 12
pyrF-yciH 0.410 13
uvrC 0.405 14
soxS 0.384 15
cynT-cynS,cynT-cynS-cynX 0.384 16
cynR 0.384 17
apaH-apaG-rsmA-pdxA-surA,surA,rsmA-pdxA-surA 0.380 18
yaiZ 0.373 19
ybaB-recR 0.358 20
omrB 0.347 21
dnaX-ybaB-recR,dnaX 0.329 22
uidR 0.327 23
purA-nsrR,purA 0.308 24
uidC-uidB-uidA 0.307 25
ybhB 0.306 26
sibE 0.305 27
nuoG 0.300 28
dcrB 0.299 29
insZ 0.297 30
fdhD 0.295 31
yehE 0.295 32
fruA-fruK-fruB 0.294 33
setB 0.294 33
glnB-yfhA,yfhA 0.283 35
uxuR 0.277 36
yeiB-folE,folE 0.276 37
yejG5p 0.273 38
rsxA-rsxB,rsxA-rsxB-rsxC-rsxD-rsxG-rsxE-nth 0.268 39
yfgD 0.266 40
patD 0.262 41
ygfF 0.259 42
ykgR 0.257 43
ykfI-yafW-ykfG-yafX-ykfF-ykfB-yafY-ykfH 0.255 44
ykfI-yafW-ykfG-yafX-ykfF-ykfB-ykfH 0.255 45
uspB 0.253 46
uspA 0.253 46
oppB-oppC-oppD-oppF 0.253 48
yhgO 0.252 49
yhgP 0.252 49
glgP-glgA-glgC-glgX-glgB,glgB 0.252 51
nfrA-nfrB,nfrB 0.251 52
deoB-deoD 0.247 53
torS 0.243 54
appA 0.239 55
gcvP 0.237 56
nc8 0.236 57
ydgA 0.235 58
narV-narW 0.228 59
rcsF-metQ-metI-metN,metQ-metI-metN 0.225 60
gmhB-rrsH,gmhB 0.225 61
dsbB-nhaB,nhaB 0.225 62
fadR 0.220 63
lipB-ybeD,ybeD 0.219 64
lipB 0.219 65
lysC5p 0.219 66
bssS 0.219 67
yceJ-yceO-solA,yceO-solA,solA 0.219 68
ubiE-ubiJ-ubiB-tatA-esrE,ubiE-ubiJ-ubiB-tatA-tatB-esrE,ubiE-ubiJ-ubiB 0.218 69
zntR-yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,yhdN-rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM,rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM 0.217 70
rplQ-rpoA-rpsD-rpsK-rpsM-rpmJ 0.217 70
dinB-yafN,dinB-yafN-yafO-yafP 0.215 72
yhjJ 0.213 73
fabF 0.206 74
lexA-dinF-yjbJ,lexA,lexA-dinF 0.206 75
plsB 0.206 76
pepT 0.206 77
potD-potC-potB-potA,potC-potB-potA 0.206 78
lolA-rarA 0.203 79
sbp 0.201 80
oppA-oppB-oppC-oppD-oppF,oppA-oppB,oppA-oppB-oppC 0.201 81
ryjA 0.200 82
yniD 0.193 83
isrC,flu-isrC 0.193 84
flu 0.193 85
tatD 0.191 86
bacA 0.191 87
plsY 0.191 88
dicA 0.190 89
yeaC 0.188 90
yehA-yehB-yehC-yehD 0.186 91
yhjH 0.186 92
kdgK 0.186 92
yaiY 0.186 94
carB 0.184 95
mlaA 0.184 96
yfdC 0.184 96
hfq-hflX-hflK,hfq,hfq-hflX-hflK-hflC,hfq-hflX 0.183 98
recA,recX-recA 0.183 99
tus 0.178 100
nrdB-yfaE 0.178 101
yoaM 0.178 102
wcaM-wcaL-wcaK 0.177 103
yjbJ 0.177 104
lfhA 0.175 105
yggN-yggL-trmI,yggL-trmI 0.175 106
mutY-yggX-mltC,mutY-yggX-mltC-nupG,mutY-yggX 0.175 107
ileX 0.174 108
yciU-clsA 0.172 109
yciY 0.172 110
codA 0.172 111
livJ 0.171 112
ftsZ,ftsZ-lpxC-secM,ftsZ-lpxC 0.171 113
nhaR 0.169 114
pdxY-tyrS,tyrS 0.169 115
ybaE 0.167 116
ynfA 0.167 117
dxr-ispU-cdsA 0.167 118
ygdG 0.166 119
gltL-gltK-gltJ-gltI-sroC,gltL-gltK-gltJ-gltI 0.162 120
yhcF3p 0.162 121
ynaJ 0.162 122
zapC 0.161 123
ftnA 0.159 124
yfhG 0.158 125
glnB 0.158 126
dhaR 0.158 127
dhaM-dhaL-dhaK 0.158 128
pka 0.156 129
tam 0.156 130
yehS 0.156 131
otsA-otsB 0.156 132
ohsC 0.155 133
shoB 0.155 134
tldD 0.155 135
glmS 0.152 136
kduI 0.151 137
ygeA 0.149 138
phoU-pstB-pstA-pstC 0.149 139
yffO-yffP 0.148 140
bepA-yfgD 0.147 141
yfgO 0.147 142
galK 0.147 143
ftsP 0.146 144
rpsO,pnp-rpsO 0.146 145
serC-aroA-ycaL,serC,serC-aroA 0.146 146
glrK 0.146 147
yjgH 0.146 148
argA 0.145 149
amiC 0.145 150
rssB-galU,rssB 0.144 151
rsmB 0.144 152
modB-modC 0.144 153
yedD 0.143 154
yedE-yedF,yedE-yedF-yedK-yedL 0.143 155
marC 0.143 156
insH-6 0.142 157
ydjN 0.140 158
rpmF-plsX-fabH,rpmF-plsX,rpmF-plsX-fabH-fabD-fabG 0.140 159
nc3 0.140 160
yaeI 0.140 161
fieF-pfkA,fieF 0.139 162
amyA 0.139 163
fes-entF-fepE-ybdZ,fes-ybdZ 0.139 164
dsbA 0.138 165
lysS-prfB 0.137 166
ahpF 0.137 167
yecJ-azuC,azuC 0.137 168
alsE-alsC-alsA-alsB-rpiR,alsA-alsB-rpiR,alsB-rpiR,rpiR 0.136 169
bisC 0.135 170
yiaD 0.135 171
ybbN-ybbO-tesA,ybbO-tesA 0.135 172
rluA-rapA,rapA 0.135 173
lhr 0.135 174
gpp 0.134 175
yfjP-yfjQ 0.133 176
plsX-fabH-fabD-fabG 0.133 177
kdpE-kdpD,kdpD 0.132 178
ykgD 0.130 179
ecnA-ecnB 0.130 180
epmB 0.130 181
gapC 0.130 182
cybB,cybB-ydcA-sokB 0.130 183
yigM 0.129 184
mnmH,ylbG-mnmH 0.129 185
apbE 0.129 186
fabR-yijD 0.129 187
sthA 0.129 188
yphD-yphE-yphF 0.129 189
uacT 0.129 190
ygdT 0.128 191
mukF-mukE 0.128 192
leuU-secG-glmM,glmM 0.127 193
yaeF 0.127 194
ygfZ 0.126 195
glpR 0.125 196
ygbK 0.125 197
btuC-ihfA,ihfA 0.125 198
btuD-btuE-btuC,btuE-btuC 0.125 199
flk 0.125 200
dedA-truA-usg-pdxB,truA-usg-pdxB,pdxB 0.125 201
cmtB-tktA,tktA 0.125 202
loiP 0.125 203
leuB-leuA 0.125 204
leuD-leuC-leuB-leuA-leuL,leuL 0.125 205
yhcN 0.125 206
flgN-flgM 0.124 207
hisS-ispG-yfgA,yfgA 0.124 208
yfbR 0.123 209
ykiE 0.122 210
aes 0.122 211
ydcS-ydcT-ydcU-ydcV-patD 0.121 212
ymgE 0.121 213
ycgR 0.121 214
ycgY 0.121 215
xapB-xapA 0.121 216
yfeN 0.121 216
tnaB 0.120 218
nsrR-rnr-rlmB-yjfI,nsrR-rnr-rlmB,nsrR-rnr 0.120 219
glyU 0.120 220
torD 0.120 221
yjjA-dnaC-dnaT,dnaC-dnaT 0.119 222
ykiC 0.118 223
kbaZ-agaV-agaW-agaA 0.118 224
agaR 0.118 225
yeaT 0.118 226
yceB-grxB,grxB 0.116 227
rhoL-rho,rhoL-rho-wecA,rhoL-rho-wecA-wzzE,rhoL 0.115 228
gfcA 0.115 229
fadJ-fadI 0.115 230
mcrC-mcrB 0.114 231
symR 0.114 232
argQ-argZ-argY-argV-serV 0.114 233
csrA,argZ-argY-argV-serV-csrA 0.114 234
yqgD 0.114 235
rlmJ-gor,rlmJ-gor-agrA,rlmJ 0.113 236
paaX-paaY 0.113 237
purB-hflD 0.113 238
exuR 0.112 239
queG 0.112 240
yejK 0.112 241
yejL,yejL-yejM,yejL-yejM-proL 0.112 242
osmY,osmY-ytjA 0.112 243
atoS-atoC 0.111 244
rcsC 0.111 245
iaaA-gsiA,iaaA-gsiA-gsiB-gsiC-gsiD 0.111 246
hisB-hisH-hisA-hisF-hisI 0.111 247
zraP 0.111 248
zraS-zraR 0.111 249
atpD 0.110 250
yhbX 0.110 251
galU 0.110 252
sapB-sapA-ymjA,sapA-ymjA,ymjA 0.109 253
sapF-sapD-sapC-sapB-sapA,sapC-sapB-sapA,sapA 0.109 254
ypfJ-purC-bamC,purC-bamC,bamC 0.109 255
ydcX 0.109 256
yaaW 0.109 257
ybdR 0.108 258
yajC-secD,yajC,yajC-secD-secF 0.108 259
cca 0.108 260
greB-yhgF,greB 0.108 261
yhgF-feoA,yhgF 0.108 262
envZ-ompR,ompR 0.108 263
ygfI5p 0.108 264
argI 0.107 265
yohF 0.107 266
ybaN-apt,ybaN 0.107 267
yibY 0.107 268
yzcX 0.107 269
cyaY 0.107 270
ychT 0.106 271
ychE 0.106 271
oppA5p 0.106 273
alkA 0.105 274
yegD 0.105 275
gfcD-gfcC 0.105 276
yegX 0.105 277
apaH-apaG-rsmA-pdxA,rsmA-pdxA 0.104 278
phnP-phnO-phnN-phnM-phnL 0.104 279
ygiT 0.103 280
uhpT 0.103 281
ychF-pth 0.103 282
ychH 0.103 283
uspE-fnr,fnr 0.103 284
yhaO-yhaM 0.102 285
yaaA 0.102 286
dnaJ-insL-1 0.102 287
tmpR 0.101 288
accA 0.101 289
yhbY 0.100 290
insB9 0.100 291